Mezi speciální struktury fluorescenčních mikroskopů patří:
(1) Systém barevných filtrů
Blok barevného filtru je důležitou součástí fluorescenčního mikroskopu a jeho základní součásti se skládají z prvního bariérového filtru pro excitační světlo, druhého bariérového filtru pro emisní světlo a zrcadla rozdělujícího paprsek. Modely barevných filtrů a názvy různých výrobců jsou často nekonzistentní.
1. Filtr excitačního světla a filtr emisního světla: Na základě charakteristik světelného zdroje a fluorescenčního pigmentu se obvykle vybírají následující tři typy přizpůsobení, aby poskytly excitační světlo v určitém rozsahu vlnových délek a umožnily fluorescenci excitované vzorkem projít skrz a dostat se do okuláru pro zobrazení.
UV excitace: Filtr excitačního světla může umožnit průchod UV záření a blokovat průchod viditelného světla nad 400 nm. Odpovídající emisní světelný filtr umožňuje průchod modrého světla a světlo v zorném poli se jeví jako modré, jako například při barvení DAPI.
Excitace modrým světlem: Filtr excitačního světla může umožnit průchod modrého světla a blokovat světlo z jiných vlnových délek. Odpovídající emisní světelný filtr umožňuje průchod zeleného světla, jako jsou značky barvení GFP.
Excitace zeleného světla: Filtr excitačního světla umožňuje průchod zeleného světla a blokuje světlo z jiných vlnových délek. Odpovídající emisní světelný filtr obvykle umožňuje průchod červeného světla, jako je barvení rodaminem.
2. Poloprůhledný a poloreflexní barevný filtr: Jeho funkcí je zcela blokovat průchod excitačního světla a odrážet jej; A vyzařovat světlo v odpovídajícím rozsahu vlnových délek. Jeho model odpovídá filtru excitačního světla a filtru emisního světla.
(2) Objektiv a okulár
Lze použít různé objektivy, ale nejlepší je zvolit čočky s přidanou stupnicí a redukcí chromatické aberace, protože jejich vlastní fluorescence je extrémně nízká a jejich výkon prostupu světla (rozsah vlnových délek) je vhodný pro fluorescenci. Vzhledem k tomu, že jas fluorescence obrazu v poli mikroskopu je přímo úměrný druhé mocnině poměru apertur čočky objektivu a nepřímo úměrný jejímu zvětšení, měla by být pro zlepšení jasu fluorescenčních obrazů použita čočka objektivu s větším poměrem clony. Zejména u preparátů s nedostatečnou fluorescencí by měla být použita čočka objektivu s vysokým poměrem apertury a vysokou propustností světla doplněná okulárem s co nejmenším zvětšením.
(3) Ostatní optická zařízení
Reflexní vrstva zrcadla je obvykle potažena hliníkem, protože hliník absorbuje méně ultrafialového a viditelného světla v modrofialové oblasti a odráží více než 90 % (zatímco stříbro má odrazivost pouze 70 %). Obecně se používají plochá zrcadla. Zaostřovací čočka, speciálně navržená a vyrobená pro fluorescenční mikroskopy, je vyrobena z křemenného skla nebo jiného skla, které propouští ultrafialové světlo. Zařízení dopadajícího světla, kromě toho, že má funkci transmisního světelného zdroje, je vhodnější pro přímé pozorování neprůhledných a poloprůhledných vzorků, jako jsou silné fólie, filtrační membrány, bakteriální kolonie, tkáňové kultury a další vzorky. V posledních letech bylo vyvinuto mnoho nových typů fluorescenčních mikroskopů využívajících zařízení s padajícím světlem, známé jako fluorescenční mikroskop s padajícím světlem.
